Всем вроде бы хорош почтовый клиент Mozilla Thunderbird: бесплатный, функциональный, шустрый. Но почему-то разработчики не считают нужным предоставить пользователю возможность быстро и по своему желанию изменить расположение почтовых ящиков в списке. А способ есть.

По шагам:
1)] В главном меню программы выберите Инструменты, и в выпавшем списке - Настройки.

2) В открывшемся окне настроек выберите вкладку "Дополнительно", где вы увидите кнопку "Редактор настроек". Кликнув по ней откроется окно с заголовком "about:config".

3) В поле "Фильтр" введите "mail.accountmanager" (без кавычек), в ответ на что появится три пункта Имён настроек.
Настройка mail.accountmanager.accounts как раз и отражает порядок расположения ящиков-аккаунтов (см. графу Значение).

4) По двойному клику на этой строке появится окно, в котором можно изменить порядок аккаунтов (account1,account2,account3).

Обычно на первом месте всегда стоит так называемый "Ящик по умолчанию", имейте в виду. Но этот статус тоже можно поменять - настройка mail.accountmanager.defaultaccount. Меняется так же, как в пункте 4.

И наконец последний вопрос - как же понять, какой именно почтовый ящик скрыт под записями
account1, account2 и т.д.? Снова обратимся к полю "Фильтр", наберите в нём "mail.server.server" (без кавычек) и получите список настроек с различными номерами после слова server. Нас интересуют настройки вида mail.server.server?.name, где знаку вопроса соответствует какая-либо цифра. В графе Значение и отображается почтовый ящик.

После внесения изменений закройте окно "about:config", в окне "Настройки" нажмите "Ок" и перезапустите программу.